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园艺论文_芥菜种子颜色调控基因TT8的等位变异
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摘要：文章摘要:在芸薹属植物中TT8基因是种子颜色的调控基因。异源四倍体芥菜TT8基因有2个拷贝，分别位于A09与B08染色体上。本研究针对不同拷贝设计特异引物，对749份芥菜进行扩增、测序
文章摘要:在芸薹属植物中TT8基因是种子颜色的调控基因。异源四倍体芥菜TT8基因有2个拷贝，分别位于A09与B08染色体上。本研究针对不同拷贝设计特异引物，对749份芥菜进行扩增、测序或酶切检测，发现BjuA09.TT8和BjuB08.TT8各有7个和6个等位变异。与野生型相比，BjuA09.TT8.a1-a5和BjuB08.TT8.b1-b4等位基因都发生了大片段插入，而BjuA09.TT8.a6出现了删除，但BjuB08.TT8.b5仅在第7外显子处有1个碱基替换。使用Repeatmasker软件对等位基因序列与甘蓝型油菜注释库进行重复序列比对，发现BjuA09.TT8.a1-a4和BjuB08.TT8.b1-b4等位基因主要含有Ⅰ类转座子，少量为Ⅱ类转座子及Helitron类转座子插入。统计还发现，BjuA09.TT8.a4-BjuB08.TT8.b5单倍型为主要的黄籽单倍型，占所分析黄籽材料的89.49% （247/276），其次为BjuA09.TT8.a4-BjuB08.TT8.b3单倍型，占6.52%。地理分布分析结果显示，中国尤其是新疆芥菜黄籽突变等位基因频率显著高于世界其他地区，这与历史记载相印证，说明芥菜黄籽性状可能起源于中国新疆。本研究结果为油菜黄籽育种选用优异基因资源提供了依据。
文章关键词:
论文分类号:S637
文章来源：《种子科技》 网址: http://www.zzkjzz.cn/qikandaodu/2021/1021/1809.html